Antibiotikaresistenz
18. Dezember 2025
Datenverzerrung verringert Zuverlässigkeit von KI-Vorhersagemodellen
Die
meisten klassischen Methoden des maschinellen Lernens – Technologien,
die aus Daten lernen und ohne explizite Programmierung selbstständig
Muster erkennen – erfordern, dass die Trainingsdaten unabhängig und
identisch verteilt sind. Das ist bei Bakterienproben allerdings nicht
der Fall: Eng verwandte Bakterien weisen viele gemeinsame Merkmale
auf. Während einer Epidemie setzen sich „erfolgreiche” Erregervarianten
schnell durch.
Dies kann den Anschein erwecken, dass bestimmte
genetische Merkmale direkt mit einer Resistenz zusammenhängen, obwohl
sie in Wirklichkeit nur aufgrund der Verwandtschaft der Erreger
gemeinsam auftreten. Die Algorithmen lernen folglich, verwandte Stämme
vorherzusagen, anstatt die Resistenz selbst.
Yu Y, Wheeler NE, Barquist L
Biased sampling driven by bacterial population structure confounds machine learning prediction of antimicrobial resistance
PLOS Biology (2025), DOI: 10.1371/journal.pbio.3003539
https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3003539
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